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月经后第三天有可能怀孕，但概率相对较低。

1.从女性生理周期来看，一般在月经周期的中间时段，即排卵日前后怀孕的几率较大。而月经后第三天通常离排卵日还有一段时间，此时卵巢可能还没有排卵，所以怀孕的机会较小。但需要注意的是，女性的排卵时间并非绝对固定，可能会受到多种因素影响而出现提前排卵的情况。

2.部分女性可能存在月经周期不规律的现象，那么就无法准确判断排卵时间，这种情况下在月经后第三天发生性行为，也不能完全排除怀孕的可能性。

3.即使是在安全期内进行性生活，也不能保证百分百不会怀孕。因为精子在女性体内可以存活一定时间，如果之后提前排卵，也有可能与精子结合而受孕。

综上所述，虽然月经后第三天怀孕的可能性较小，但仍不能掉以轻心。如果没有怀孕计划，建议采取有效的避孕措施，以避免意外怀孕带来的困扰和风险。同时，对于有生育需求的女性，可以通过监测排卵等方法来提高受孕几率。